近年来，武进区审计局对区财政及部分区级部门的预算执行情况进行了审计。审计发现在预算执行过程中存在一些需规范完善的方面：项目预算执行率偏低、项目资金使用核算不规范、收支余反映不实、资产管理不够完善、财务内控制度不够严格等。审计部门及时提出了有针对性的审计建议。

武进区财政局十分重视审计建议，积极进行财政改革，采取措施加强部门预算等管理工作，财政管理水平进一步提高。一是规范预算指标管理。规范指标申请、调整程序，明确指标结余处理要求，完善支出指标监督办法，切实维护财政预算支出的严肃性。二是强化区级财政专项资金管理。制定区级财政专项资金管理办法，强化分级、分类审核要求，规范资金拨付程序。三是编细、编实部门预算。从严控制一般性支出增长，控制并加强“三公经费”管理，合理调整编外用工、公务用车等经费定额标准等。四是开展“小金库”专项清理和预算执行情况检查。规范部门单位津补贴发放、资金使用行为，针对问题，研究对策措施，建立长效防范机制。五是加强往来款核算管理。对不同预算单位的往来款核算通过信息系统实行差别化管理，加强单位结余管理，杜绝单位隐匿财政收入、不按规定列支情况的发生。六是清理规范财政账户。2011年全区共撤销财政账户53个。七是落实全区会计人才建设规划。提升行政事业单位会计人员业务水平和职业素养，提高预算执行能力。